chn

一、  快速参考信息

进行计算时，保留2核2GB供操作系统使用

node1：

操作系统centOS 6.3

CPU20核、内存32GB

公用计算程序：gaussian16_c01，orca4.2.1

node2：

操作系统centOS 8

CPU48核、内存128GB

公用计算程序：gaussian16_a03，orca4.2.1，MaterialStudio2020

公用账号：

（供初学者临时学习使用）

账号

密码

如果需要长期使用，向老师申请，并使用root账号添加新的用户。如果需要使用公用的计算程序，按照下面的说明将对应的环境变量添加到自己账号目录下的.bashrc

二、  程序使用

公用计算程序安装在 /home 下

请勿修改公用计算程序文件夹的 用户组、权限等等

node1&2的安装路径完全一致。

一号机-node1

gaussian16

g16-C01-AVX版

用户使用

1.将用户加入高斯工作组：work，获取公共高斯程序读写权限（root下运行）

groupmems -g work -a username

2.添加环境变量

在/home/username/ 下找到 .bashrc 添加下面内容

export g16root=/home
export GAUSS_SCRDIR=/home/g16/scratch
source /home/g16/bsd/g16.profile

orca421

位置 /home/orca421

位置 /home/openmpi314

变量信息参考 node2 里的内容

二号机-node2

gaussian16

g16-A03-AVX2版

变量和node1相同

orca421

orca-需要使用非root账号运行

在/home/username/ 下找到 .bashrc 添加下面内容

#orca412 by chn
alias orca=/home/orca421/orca
export LD_LIBRARY_PATH=/home/orca421:$LD_LIBRARY_PATH

#Open MPI 4 orca by chn
export PATH=/home/openmpi314/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/home/openmpi314/lib:$LD_LIBRARY_PATH

MaterialStudio2020

windows端添加服务器：

ip:18888

管理员信息

三、  软件信息

node1

g16-C01-AVX版

Default.Route信息

-M- 12GB
-P- 20

位置 /home/g16

g16 用户:用户组=350:work 权限=750

其中scratch 权限=770 （需要读写权）

安装

1. 解压
2. groupadd work
3. usermod -g work username
4. chown -R 350:work g16
5. chown -R 350:work scratch
6. chmod -R 770 scratch

node2

g16-A03-AVX2版

Default.Route信息

-M- 24GB
-P- 24

orca421

安装教程 https://alexander-qi.github.io/2020/installorca/

依赖库openmpi-3.1.4安装位置 /home/openmpi314

orca-4.2.1 安装位置 /home/orca412

安装记录：

教程中缺少一处修改：./bashrc 中加上，用来加载orca的动态库

export LD_LIBRARY_PATH=/root/orca412/orca_4_2_1_linux_x86-64_shared_openmpi314:$LD_LIBRARY_PATH

教程中下面这个环境变量的lib64应该改为lib

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/openmpi314/lib

MaterialStudio2020

【Linux】Material Studio 2020 安装教程

TensorFlow2

https://cloud.tencent.com/developer/article/1693084

https://tensorflow.google.cn/install?hl=zh-cn

python3和pip3在root的～下安装

tf在root下用pip3 安装

其他软件

https://www.cnblogs.com/architectforest/p/12523286.html

yum install epel-release #epel软件源
yum install screen #screen软件

四、硬件信息

一号机

CPU：E5-2620（6c12t） 双路，共计12c24t

E5-2670v2（10c20t），共计20c40t。

内存：4*8GB DDR3-1333

硬盘：1000GB

2022/10/30 chn：更换CPU E5-2670v2（10c20t），共计20c40t。同时更新IPMI、BIOS以适配新CPU

IPMI在centos下更新，BIOS在DOS下更新，这里推荐使用FreeDOS代替。

二号机

CPU：Xeon Platinum 8163（24c48t） 双路，共计48c64t

内存：8*16GB DDR4-2666 ECC

硬盘：500GBsata固态